After Effects で、プレビューのときは音はあっていたのに、レンダリングをした映像は音がずれてしまいました。
ネットで調べたら、答えがでていました！
http://oshiete.goo.ne.jp/qa/5610418.html?&status=true&errcode=&msg=&qid=5610418

私の撮影したカメラは30fpsだったのですが、コンポジションの設定は20fpsだったので、音のずれがでてしまったようです。プレビューで確認すると音はちゃんと映像に合っているのですが、レンダリングをするとずれがでるようです。

コンポジションの設定を30fpsにしたら、解決しました。